MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. vesicatoria str. 85-10 plasmid pXCV19

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007505	ACCA	2	8	452	459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_007505	AAT	2	6	664	669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007505	CTTTT	2	10	3091	3100	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_007505	CCCGC	2	10	3734	3743	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5	NC_007505	TTGG	2	8	3751	3758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007505	GTG	3	9	4305	4313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007505	GCT	2	6	4374	4379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007505	GATC	2	8	4404	4411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_007505	GGT	2	6	4441	4446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007505	GCC	2	6	4482	4487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007505	ATAG	2	8	4587	4594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007505	AT	3	6	5592	5597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007505	CAC	2	6	7279	7284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_007505	ACC	2	6	7965	7970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_007505	GGA	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007505	TGCCC	2	10	8034	8043	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_007505	CTC	2	6	9235	9240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_007505	CTT	2	6	9256	9261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_007505	CT	4	8	9350	9357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007505	GGAC	2	8	10140	10147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_007505	GAA	2	6	10150	10155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007505	ATC	2	6	10178	10183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007505	GTT	2	6	11310	11315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007505	TTG	2	6	11323	11328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007505	CT	3	6	14993	14998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007505	T	9	9	15045	15053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007505	CAA	2	6	15123	15128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_007505	ATT	2	6	15167	15172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007505	TCAT	2	8	16301	16308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_007505	T	6	6	16316	16321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007505	ACG	2	6	16362	16367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007505	AGG	2	6	16369	16374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007505	AGT	3	9	16440	16448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007505	AGAGG	2	10	16466	16475	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007505	TAGA	2	8	16511	16518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007505	ATC	2	6	16522	16527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007505	T	7	7	16539	16545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007505	GAA	2	6	16607	16612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007505	CAA	2	6	16667	16672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007505	CCG	2	6	16727	16732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_007505	GCC	2	6	16741	16746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_007505	GGC	2	6	16749	16754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007505	CGCC	2	8	16838	16845	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_007505	GCC	2	6	16924	16929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_007505	GGC	2	6	16933	16938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007505	GCCC	2	8	16978	16985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_007505	TGG	2	6	17042	17047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007505	GCA	2	6	17099	17104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007505	GCCC	2	8	17105	17112	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_007505	GTAA	2	8	17220	17227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007505	GTT	2	6	17316	17321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007505	TGAGT	2	10	17329	17338	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007505	CA	3	6	18068	18073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_007505	A	6	6	18073	18078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007505	T	7	7	18093	18099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007505	GCC	2	6	19105	19110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.